Acetilación y amidación: extremos del péptido

La acetilación y la amidación son dos modificaciones de síntesis que bloquean los extremos de la cadena peptídica. La acetilación N-terminal añade un grupo acetilo al inicio de la secuencia; en la notación estándar aparece como Ac- antes del primer aminoácido. La amidación C-terminal reemplaza el grupo carboxilo del final por un grupo amida; se escribe como -NH2 después del último aminoácido. Las dos neutralizan las cargas eléctricas en los extremos y, según la literatura de síntesis de péptidos, reducen la susceptibilidad del compuesto a las enzimas que degradan desde los extremos de la cadena.

Los dos extremos de una cadena peptídica

Una cadena de aminoácidos tiene dos puntas. El extremo N-terminal es donde la cadena empieza: queda libre un grupo amino (-NH2). El extremo C-terminal es donde termina: queda libre un grupo carboxilo (-COOH). En un entorno acuoso con sales, esos grupos se ionizan: el amino tiende a cargarse positivamente y el carboxilo negativamente.

Esa carga tiene consecuencias concretas. Los extremos libres son el punto de entrada de las enzimas proteolíticas que degradan los péptidos desde afuera hacia adentro: las aminopeptidasas actúan sobre el N-terminal libre, y las carboxipeptidasas sobre el C-terminal libre. Esas enzimas están presentes en suero, tejido e intestino, y un péptido sin modificaciones puede tener una vida media muy corta cuando se lo expone a esos entornos. Bloquear los extremos le quita a esas enzimas el sustrato que reconocen.

La síntesis química en fase sólida permite incorporar cualquiera de las dos modificaciones, o las dos, antes de liberar el péptido del soporte de síntesis.

Qué hace la acetilación en el N-terminal

La acetilación N-terminal es la adición de un grupo acetilo (CH3CO-) al nitrógeno del primer aminoácido. Eso convierte el grupo amino libre en un grupo acetamido: desaparece la carga positiva en ese extremo, y la aminopeptidasa deja de reconocerlo como sustrato porque el sitio activo de esa enzima requiere un amino libre para anclarse.

La modificación no es exclusiva de la síntesis. Estudios de proteómica publicados en los últimos veinte años muestran que entre el 80 y el 90 % de las proteínas humanas maduras tienen el N-terminal acetilado *in vivo*; la catalizan enzimas llamadas N-acetiltransferasas (NATs) durante o después de la traducción. La base de datos PubMed reúne los trabajos relevantes para quien quiera profundizar. La síntesis química reproduce ese estado mediante una reacción de acetilación controlada directamente sobre el soporte sólido.

En la notación de la secuencia, Ac- delante del primer aminoácido indica que ese extremo está acetilado en el lote.

Qué hace la amidación en el C-terminal

La amidación C-terminal reemplaza el -COOH del último aminoácido por un grupo amida (-CONH2). La carga negativa del carboxilo desaparece, y la carboxipeptidasa pierde el sustrato que reconocería para empezar a degradar desde ese extremo.

En la biología también existe esta modificación. Muchos péptidos bioactivos identificados en tejidos de mamíferos terminan en amida: la oxitocina, la vasopresina, la gastrina y la amilina son ejemplos que aparecen en la literatura desde hace décadas. *In vivo*, la cataliza la enzima PAM (*peptidylglycine alpha-amidating monooxygenase*), cuyo mecanismo está documentado en estudios publicados en PubMed. En síntesis química se obtiene eligiendo un tipo de resina que entrega el grupo amida al momento de la desprotección final.

La notación -NH2 al final de la secuencia —o el sufijo -amide— indica que el C-terminal fue amidado en la síntesis.

Cómo leer la notación en la ficha de un compuesto

Un péptido con las dos modificaciones se escribe:

Ac-[secuencia de aminoácidos]-NH2

El prefijo señala el N-terminal acetilado; el sufijo, el C-terminal amidado. Un péptido sin ninguna de las dos aparece como H-[secuencia]-OH, donde H- indica el amino libre y -OH el carboxilo libre. Si lleva solo una modificación, la notación lo refleja: Ac-[secuencia]-OH tiene el N-terminal bloqueado pero el C-terminal libre; H-[secuencia]-NH2 tiene el C-terminal amidado pero el N-terminal libre.

La diferencia de masa entre un péptido sin modificar y uno con las dos es cuantificable por espectrometría de masas. El grupo acetilo suma exactamente 42,04 Da. La sustitución del -OH del carboxilo por -NH2 ajusta la masa en -0,98 Da. Un certificado de análisis que incluya ese dato permite verificar que las modificaciones declaradas están presentes en el lote específico: si la masa medida coincide con la masa teórica para la secuencia modificada, la identidad del compuesto está confirmada para ese lote.

En la sección de calidad de PeptoClinic se detallan los parámetros que incluye cada informe de laboratorio y cómo interpretarlos.

Compuestos del catálogo que llevan estas modificaciones

Varios compuestos del catálogo de PeptoClinic se sintetizan con una o las dos modificaciones de extremos.

Semax —el heptapéptido Met-Glu-His-Phe-Pro-Gly-Pro— lleva las dos. Su fórmula publicada es Ac-Met-Glu-His-Phe-Pro-Gly-Pro-NH2: N-terminal acetilado y C-terminal amidado. Las dos modificaciones son parte de la identidad química del compuesto; cambiar cualquiera produce una molécula distinta.

Ipamorelin lleva amidación C-terminal; la secuencia termina en -NH2 y eso figura en la especificación de identidad del lote. Sermorelin, el análogo sintético de los primeros 29 aminoácidos del GHRH humano, también tiene el C-terminal amidado según la secuencia publicada en la literatura.

Si la referencia que usás para diseñar el experimento especifica un compuesto con Ac- y -NH2, ese es el que hay que solicitar. Un lote de la misma secuencia sin esas modificaciones es un compuesto distinto y los resultados no son directamente comparables.

Material para investigación de laboratorio

Todo el material que PeptoClinic Research Supply suministra está destinado exclusivamente a investigación de laboratorio (*Research Use Only*, RUO): ensayos *in vitro* y estudios preclínicos. Ningún compuesto del catálogo está aprobado para uso en humanos ni en animales por ninguna autoridad regulatoria. PeptoClinic no es una farmacia, no elabora medicamentos y no provee orientación sobre administración. Las condiciones de envío para Argentina y el proceso de cotización están disponibles en la página de envíos.